More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2367 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  56.84 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  57.89 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  58.24 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  58.24 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  56.84 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  56.38 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  61.45 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  55.79 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  52.13 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  55.79 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  51.06 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  53.76 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  48.94 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  52.69 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  54.44 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  50.59 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  55.7 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  49.45 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  54.35 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  46.15 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  52.56 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  54.35 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  48.91 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  43.01 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  44.94 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  47.78 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  46.74 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  47.92 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>