More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1264 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
127 aa  239  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
117 aa  239  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  84.62 
 
 
117 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  64.81 
 
 
118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  59.62 
 
 
111 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  57.94 
 
 
113 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  58.95 
 
 
116 aa  119  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  54.9 
 
 
124 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  52.29 
 
 
124 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  56.99 
 
 
129 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 
119 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
117 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  51.72 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  52.69 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  56.96 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
109 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
116 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
113 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  49.44 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  50.57 
 
 
113 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
112 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  51.72 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 
94 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3674  ArsR family transcriptional regulator  56.58 
 
 
93 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  42.99 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
107 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
96 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.54 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.43 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.25 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  42.57 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  43.62 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  45.98 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.68 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  38.54 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  38.54 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
114 aa  76.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  43.96 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  38.68 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  40 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  44.68 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>