More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0205 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  216  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.25 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  54.35 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  51.72 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  40.66 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  40.2 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  38.54 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  39.39 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  44.94 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  44.19 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  36.84 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  50.67 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  43.37 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  36.84 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  43.21 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  33.33 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.95 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>