More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2290 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  78.75 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  46.25 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  45.57 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  43.21 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  40.74 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  45.68 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.27 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  37.5 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  35.37 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  35.37 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  32.1 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.84 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.33 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>