More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3721 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  209  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  76.77 
 
 		 106 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 106 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  81.32 
 
 		 113 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  65.22 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  52.17 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  52.22 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  51.16 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  48.91 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  50 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  46.74 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  48.42 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.83 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  48.35 
 
 		 101 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  50.59 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  49.45 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  46.99 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  41.76 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  55.06 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  51.11 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  48.28 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  50.56 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  49.43 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 113 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  43.68 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>