More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1106 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 83 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.74 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  50.56 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.24 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  45.16 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  42.57 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.76 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  37.25 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  46.34 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.96 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  38.14 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  36.46 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  42.11 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  34.02 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.08 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  37.11 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>