More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1236 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  55.21 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  52.69 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  50 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  48.91 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  52.17 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  47.83 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  44.68 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  48.35 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  45.45 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  48.48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  43.16 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.47 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  49.38 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  45.45 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  48.89 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.74 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  41.3 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  56 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.91 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  47.19 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  41.76 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  42.11 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  43.33 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  47.47 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  43.96 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>