More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5676 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  78.3 
 
 		 112 aa  172  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 94 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 115 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  63.21 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  58.1 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  59.6 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  56.73 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  51.33 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  52.21 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  58.42 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  54 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  51.58 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  52.75 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  49.46 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  47.96 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  49.44 
 
 		 227 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  51.14 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  47.19 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  48.81 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 		 119 aa  83.6  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  48.81 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  34 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  41.41 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.76 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  42.57 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.18 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.71 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.21 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  40.22 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>