More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1404 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  92.17 
 
 
115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  74 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  72 
 
 
116 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
116 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
116 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 
106 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
112 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  66.32 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 
105 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
103 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  54.46 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 
104 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  54.29 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  54.37 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
96 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
96 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  51.89 
 
 
121 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 
121 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
112 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  53.26 
 
 
109 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  48.42 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  50 
 
 
110 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 
116 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  44.04 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  49.46 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  45.45 
 
 
227 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
113 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  44.76 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  39 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.76 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  38.78 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.08 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  36.08 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  36 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.71 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  35.05 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  40.4 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  38 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>