More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1942 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  52.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  53.12 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  53.41 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  45.92 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  46.74 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44.79 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  48 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  48 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  35.87 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  50.75 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  49.32 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  42.22 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>