More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004423 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  93.75 
 
 		 101 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  65.31 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  80.25 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  67.01 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  67.01 
 
 		 98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  65.98 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  67.01 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  64.95 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  56.84 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  54.64 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  54.64 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  53.61 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  54.64 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  52.58 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  52.58 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  47.42 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  47.92 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  51.61 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.4 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  44.9 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  47.78 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  47.37 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  51.58 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.71 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>