More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3331 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  85.42 
 
 
107 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  86.17 
 
 
107 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  76.47 
 
 
114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  76.47 
 
 
114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  72.12 
 
 
122 aa  146  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  75 
 
 
114 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  68.04 
 
 
115 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  67.03 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  57.95 
 
 
107 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 
112 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
96 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
104 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 
133 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
94 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
107 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
106 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
107 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  45.54 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  53.68 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
129 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 
121 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
121 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  43.14 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  41.67 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
110 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
109 aa  87.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  51.22 
 
 
227 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
125 aa  84.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  43 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 
113 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  44.83 
 
 
97 aa  83.6  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  39.05 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  52.69 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  44.09 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  37.89 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  41.9 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  47.56 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  47.56 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.21 
 
 
87 aa  77  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.11 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  40.66 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>