More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2292 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  199  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  54.26 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  53.19 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  53.12 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  53.19 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  52.63 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  52.08 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  53.19 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  50 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  48.42 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  49.47 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  53.68 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  46.88 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.47 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.05 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  52.56 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  54.32 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  48.42 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  47.37 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 108 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.49 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.67 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.18 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  43.18 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  43.96 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  41.94 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.33 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  36.73 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  45.57 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>