More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2351 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  87.23 
 
 		 106 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  80.41 
 
 		 111 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  75 
 
 		 100 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  75 
 
 		 100 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  71.28 
 
 		 98 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  66.02 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 92 aa  110  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 97 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 97 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.33 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  35.87 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  41.86 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.25 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  40.82 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.36 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  42.17 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  34.88 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  39.29 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  53.12 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  53.12 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  33.98 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  36.47 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  38.64 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  34.83 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>