More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2026 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 97 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 97 aa  196  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  35.23 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.05 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  27.59 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  29.27 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  41.27 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  29.27 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  28.26 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  29.27 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  31.25 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  31.71 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  31.71 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>