More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0757 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  90.4 
 
 		 125 aa  239  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  87.6 
 
 		 132 aa  236  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  82.95 
 
 		 129 aa  226  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  75.97 
 
 		 129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  80.18 
 
 		 111 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  95.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.18 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.54 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.54 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  42.65 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40.79 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  44.93 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  35.65 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 305 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  40.28 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>