More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1782 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  206  9e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.38 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  34.52 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  34.07 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  35.44 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  35.44 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  30.34 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  30.85 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  33.71 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  32.56 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  31.63 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  33.33 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  32.95 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  28.92 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  32.94 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.25 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>