More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0610 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
98 aa  200  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  83.16 
 
 
109 aa  166  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  76.84 
 
 
109 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.21 
 
 
106 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  67.71 
 
 
111 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  71.28 
 
 
109 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  69.57 
 
 
100 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  69.57 
 
 
100 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
92 aa  106  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 
102 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
97 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
97 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
97 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.53 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.5 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 
102 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  35.16 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  42.35 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  34.04 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  40.48 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  40 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  39.56 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  40.66 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.56 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  37.04 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 
135 aa  66.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
98 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.52 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.52 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  35.87 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>