More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0742 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
111 aa  226  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  69.16 
 
 
116 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  57.28 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  57.28 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  60.2 
 
 
117 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  60.82 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  46.46 
 
 
118 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
100 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 
111 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
110 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  44.71 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  44.58 
 
 
108 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  42.55 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.96 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  50.7 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  41.46 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  38.27 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  46.67 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>