More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3636 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  44.16 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  43.33 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  42.31 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.9 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.9 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.31 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  38.03 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  32.74 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.44 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  30.34 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>