More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0829 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.75 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.75 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 183 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.48 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  39.08 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  32.95 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.25 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>