More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2787 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  98.99 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  97.98 
 
 		 99 aa  196  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  96.97 
 
 		 99 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  88.89 
 
 		 99 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  88.89 
 
 		 99 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  87.88 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  87.88 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  87.88 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 105 aa  123  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  42.39 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  40 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  39.8 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  38.78 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  46.84 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  46.07 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.21 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  41.67 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  48.96 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.76 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  43.48 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.88 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.62 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  44.68 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  37 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  44.09 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  43.9 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  42.55 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>