More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1776 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  98.94 
 
 		 94 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  83.33 
 
 		 91 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  78.89 
 
 		 91 aa  153  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  78.41 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  78.89 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  70.65 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  50.6 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  47.5 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0069  transcriptional repressor PagR  41.18 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.96 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2840  transcriptional repressor PagR  39.76 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.660839  hitchhiker  0.0000000107753 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  40.66 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  40.74 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  42.17 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  38.55 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0145  transcriptional repressor PagR, putative  38.75 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0320  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2343  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0268  transcriptional repressor PagR  38.75 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>