More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0763 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  87.6 
 
 		 129 aa  239  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  87.6 
 
 		 129 aa  236  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  84.55 
 
 		 125 aa  223  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  79.07 
 
 		 129 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  83.78 
 
 		 111 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 		 102 aa  83.6  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  40.79 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.67 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.58 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.58 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.8 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.8 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.44 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.05 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>