More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1702 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  75.65 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  75.65 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
124 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  55.96 
 
 
114 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 
114 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
106 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
111 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  41 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  45.57 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  40.24 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  40.26 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  34.94 
 
 
219 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  29.7 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  29.7 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  36 
 
 
341 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 
108 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  34.57 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
312 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  39.47 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
305 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
309 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
307 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
120 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
341 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
310 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
122 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
105 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  30.49 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
125 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
348 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
305 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
307 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  30.21 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  28.33 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>