More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2205 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  235  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  32.67 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  33 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  34 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  34 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  31.07 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  49.18 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  30.1 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  30.84 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.33 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  34.95 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  29.52 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  28.3 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  32.53 
 
 
227 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
342 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  24.51 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
233 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  31.18 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  31.18 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  31.18 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  32.05 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  34.52 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>