More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1568 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  286  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  76.15 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  75.23 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  66.94 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  79.61 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  78.5 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  81.37 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  81.37 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  64.52 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  70.87 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  81.73 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  69.23 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  73.68 
 
 		 113 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  74.77 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  74.77 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  66 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  59.63 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  63.3 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  67.5 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  64.21 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  55.86 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  58 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  50.57 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.27 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  33.03 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  59.57 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  59.57 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.79 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.56 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>