More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0526 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  78.7 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  64.36 
 
 
118 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  56.12 
 
 
119 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
119 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 
119 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  60.82 
 
 
109 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  61.8 
 
 
124 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  58.89 
 
 
119 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 
119 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  54.64 
 
 
118 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.49 
 
 
111 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  59.09 
 
 
111 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
151 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
107 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  56.18 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
134 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  58.33 
 
 
109 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  50.54 
 
 
108 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  52.33 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  55.42 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  48 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  47.22 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
245 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  47.14 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  47.14 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  43.28 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
229 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
227 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  36 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40.28 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
239 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 
365 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>