More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  36.09 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 227 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  34.35 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.05 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  38.26 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  31.49 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.91 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  28.94 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.45 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  37.99 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  37.99 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  39.3 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  39.17 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.83 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  34.6 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.89 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  38.5 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  37.13 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.84 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  35.17 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.81 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  29 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  37.71 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  31.84 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  32.6 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 84 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 101 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 115 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 95 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 87 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  27.38 
 
 		 95 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 111 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>