107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0635 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  92.83 
 
 		 237 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  92.41 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 235 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  51.29 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  51.71 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  41.78 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.9 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  37.9 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.62 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  37.9 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  30.41 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  31.28 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  34.4 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  34.08 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  28.89 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  33.18 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  33.18 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  32.17 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  32.24 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  34.22 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  25.65 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  30.29 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  24.43 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  31.8 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.96 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.8 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.22 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  30.34 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.2 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 84 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 119 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 105 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 112 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 115 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 124 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 125 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 119 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>