235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0540 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.81 
 
 		 228 aa  317  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.81 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  57.52 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 251 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 251 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.03 
 
 		 239 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  47.6 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  50.91 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.44 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  39.27 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  37.27 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  42.93 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  42.93 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  37.9 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  41.99 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  35.91 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.81 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  40.47 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.2 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  36.04 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  36.4 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  35.22 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  37.22 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  34.08 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  34.04 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 111 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 115 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 437 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 103 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>