110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5959 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5959  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 253 aa  490  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 248 aa  357  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4624  ArsR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  57.6 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  45.85 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2887  ArsR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000918682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2855  ArsR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000262914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2816  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3103  ArsR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3107  transcriptional regulator, ArsR family  37.95 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17630  predicted transcriptional regulator  45.78 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00761162  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5271  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  48.4 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1616  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.4 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1571  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.346453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  41.88 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  41.88 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0920  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.670285  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  32.74 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0204  regulatory protein, ArsR  36.82 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.871171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0205  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  42.36 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1811  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0305796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3068  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  47.77 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  39.91 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2819  ArsR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  decreased coverage  0.0000226835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1415  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2420  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.77 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.544065  normal  0.018861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2796  transcriptional regulator, ArsR family  38.77 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.68 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  37.45 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2216  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.779866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1949  ArsR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4263  transcriptional regulator, ArsR family  37.55 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  43.61 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4373  transcriptional regulator, ArsR family  37.55 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2022  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0409  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0967  ArsR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0963  ArsR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0926  ArsR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0608  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1087  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1046  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4201  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 290 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0669  ArsR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0660  regulatory protein, ArsR  34.55 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0756  transcriptional regulator, putative  35 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4573  ArsR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000870206  normal  0.0122387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0635  ArsR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0590  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0630  regulatory protein, ArsR  30.84 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000903473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 84 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 125 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 115 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>