More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3937 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
109 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  67.89 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 
117 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 
117 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 
117 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
111 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  63 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 
125 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  60.75 
 
 
107 aa  123  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 
113 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
151 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  61.46 
 
 
111 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  60.78 
 
 
118 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  59.22 
 
 
110 aa  119  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  60.42 
 
 
168 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 
111 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
119 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
119 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  64.44 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  55.68 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  50.45 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  56.18 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
112 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
119 aa  93.6  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
399 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
251 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  47.69 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1913  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
221 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0111474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.33 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.56 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
100 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
234 aa  52  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  43.08 
 
 
138 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
228 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
230 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
125 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
232 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1308  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
244 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>