More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0327 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 165 aa  343  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  52 
 
 		 110 aa  108  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.27 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  30.2 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 305 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  28.74 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  36.9 
 
 		 336 aa  53.9  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  32.89 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2320  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 437 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  30.49 
 
 		 91 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 106 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>