More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4184 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  48.62 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  32.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  37.78 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  45.21 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  34.21 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  34.21 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 91 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  32.99 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  37.27 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  27.96 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>