More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6111 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 110 aa  226  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  64.55 
 
 		 109 aa  146  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  62.73 
 
 		 109 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  60.55 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  60.91 
 
 		 109 aa  141  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  55.45 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  55.45 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  54.55 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  53.64 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  54.65 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  43.48 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  48.61 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  41.25 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  31.03 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  41.67 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  37.65 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.25 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>