More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1513 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  223  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  59.63 
 
 		 109 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  63.64 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  63.64 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  59.09 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  59.63 
 
 		 109 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  62.73 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  53.7 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  56.48 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  53.7 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  52.29 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  50.57 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 116 aa  106  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  55.68 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  53.57 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 111 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.38 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  38.37 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  37.04 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  34.57 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.18 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.03 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>