More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1706 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
111 aa  230  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  69.37 
 
 
111 aa  159  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 
127 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 
111 aa  158  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  65.14 
 
 
111 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  65.69 
 
 
113 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  65 
 
 
113 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
116 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  44.68 
 
 
146 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  38 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.76 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.36 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  41.77 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  33.01 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  42.5 
 
 
108 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  35.23 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
297 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  32.95 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
106 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  38.75 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  37.33 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  29.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>