More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4239 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 110 aa  226  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  95.45 
 
 		 138 aa  219  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  95.45 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  69.09 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  64.52 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  54.05 
 
 		 109 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  50.91 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  61.9 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  56.12 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  56.12 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  55.1 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  56.98 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  55.81 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  58.44 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  32.58 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  42.25 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 100 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>