More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2579 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  247  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  51 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  49.47 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  49.46 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.2 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  53.66 
 
 		 183 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  48.39 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  48.86 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 349 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  41.84 
 
 		 336 aa  74.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 337 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.71 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>