More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2774 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  47.78 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  45.68 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  47.5 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 349 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  50.67 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  41.11 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  38.55 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  38.55 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.86 
 
 		 336 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  33.01 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  37.11 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.27 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.33 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.27 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  38.27 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  38.27 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 297 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>