More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1200 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35.42 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
317 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  36.59 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 
108 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
349 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  29.76 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
347 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.67 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.5 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0577  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  36.59 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
107 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.96 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>