More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1856 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 137 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  63.33 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50.82 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  52.88 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  51.33 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  61.45 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  57.89 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  55.21 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  48.74 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50.5 
 
 		 336 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  54.72 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  50.96 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  48.25 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  50.49 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  57.5 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 115 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  56.96 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 347 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.86 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 		 337 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  51.16 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 349 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 337 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  51.85 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  45.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  47.47 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  41.35 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.02 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  40.86 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  47.5 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  38.16 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>