More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0264 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  235  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 317 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  46.05 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45.21 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.06 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.06 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  33.02 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  32.67 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  32.67 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.79 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  41.1 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  44.16 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.18 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>