More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1033 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
108 aa  223  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  58.25 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  54.29 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
132 aa  116  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
134 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
110 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.94 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  45.9 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.33 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  42.25 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  42.25 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  42.25 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
317 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.91 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  31.13 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>