More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0423 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  53.47 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  53.47 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  43.55 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 87 aa  57  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.84 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  38.57 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  45.9 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.28 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.28 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 317 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  30.95 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  36.49 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  33.77 
 
 		 336 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  28.75 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  42.25 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  28.75 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  39.71 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  35.38 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 317 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>