More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4060 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  47.87 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  38.55 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  46.75 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 437 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  35.87 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 330 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  31 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  26.6 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>