More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2282 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  85.32 
 
 		 111 aa  186  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4716  transcriptional regulator, ArsR family  63.46 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.91 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 355 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  46.27 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  39.56 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  36.9 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  35.29 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  37.36 
 
 		 227 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  44.12 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>