More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  74.04 
 
 
121 aa  136  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  60.58 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  63.3 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  76.84 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  67.74 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  65.05 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  63.55 
 
 
118 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  63.55 
 
 
118 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  66.33 
 
 
134 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 
113 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  66.33 
 
 
135 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  65.35 
 
 
130 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  67.37 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  64.89 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  69.39 
 
 
134 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  63.83 
 
 
127 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  60.58 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  63.06 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  63.06 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
126 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  60.95 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  67.31 
 
 
127 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  63.16 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
143 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  61.61 
 
 
125 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  61.61 
 
 
125 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  61.61 
 
 
145 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  62.34 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.9 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.23 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  45.95 
 
 
168 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  36.59 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.86 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  46.15 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  44.16 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  50 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40.51 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40.51 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
119 aa  53.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.74 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>