More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4542 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 111 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  83.16 
 
 		 107 aa  159  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  67 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  70.19 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  73.4 
 
 		 110 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  73.2 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  69 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.83 
 
 		 111 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  71.43 
 
 		 168 aa  129  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  73.4 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  61.46 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  56.57 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  59.78 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  59.09 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  44.16 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.96 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  43.55 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.93 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  43.55 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.93 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 245 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 399 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.84 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 358 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>